归档

2024 年 12 月

【生信圆桌x教程系列】如何安装 seurat V4版本R包,最详细教程

2024-12-23

Seurat 是一个广泛使用的 R 包，专门用于单细胞基因表达数据的分析与可视化。它主要被生物信息学和生物统计学领域的研究者用来处理、分析和理解单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）数据。本文章详细的讲述了Seurat V4在ubuntu上的安装过程和方法

【生信圆桌x教程系列】如何安装 seurat V5版本R包,最详细教程

2024-12-23

Seurat 是一个广泛使用的 R 包，专门用于单细胞基因表达数据的分析与可视化。它主要被生物信息学和生物统计学领域的研究者用来处理、分析和理解单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）数据。Seurat 提供了一个集成的工作流，帮助研究者从原始的基因表达数据到最终的细胞群体发现和差异分析。

生信圆桌x西柚云：生信云服务器在单细胞分析中的优势与应用

2024-12-10

探索生信云服务器如何助力单细胞分析，提升计算效率，轻松应对大数据挑战。提供具体应用场景与推荐平台，助您加速科研进展。

独享生信云服务器，科研新动力：如何通过云服务器提升课题组效率？

2024-12-05

在生物信息学研究中，数据处理和分析是科研的重要环节。随着生物学数据量的不断增加，传统的科研计算方式往往面临着存储不足、计算速度慢和维护困难等问题。而云服务器的引入，尤其是独享生信云服务器，正为科研团队提供了新的动力。以下是通过独享生信云服务器提升课题组效率的几个关键方面：

2024 年 11 月

单细胞数据的高级应用与前沿探索：空间转录组技术及其在临床和药物开发中的应用

2024-11-21

随着单细胞组学技术的快速发展，研究人员可以从个体细胞层面揭示生物过程的异质性和特定群体的动态变化。这一技术不仅限于传统的基因表达数据，还通过多组学整合提供了跨越转录组、表观遗传组和蛋白组的全方位视角，为细胞生物学和系统生物学的研究带来了全新视野。

单细胞数据的可视化与报告生成：工具选择、图表展示与解读指南

2024-11-17

单细胞数据的可视化与报告生成：Seurat、Scanpy 工具使用指南及图表解读Description: 本文系统介绍单细胞数据可视化的核心工具，包括 Seurat 和 Scanpy 的使用方法及常用图表类型。同时讲解不同可视化图表的展示和解读技巧，提供高质量报告生成的实用指南，助力科研人员深入分析单细胞数据。

单细胞多组学数据整合：解析 ATAC-seq 与 RNA-seq 的整合及跨平台分析挑战

2024-11-16

深入解析单细胞多组学整合技术，介绍 ATAC-seq 和 RNA-seq 数据的整合分析方法，以及跨平台数据整合的挑战与解决方案，帮助科研人员更好地理解基因表达调控的精细机制。单细胞多组学整合, ATAC-seq, RNA-seq, 跨平台整合, 数据整合分析, 单细胞转录调控, 生物信息学

单细胞基因表达谱分析：差异基因表达与伪时间分析的应用

2024-11-13

当今生物信息学研究中，单细胞基因表达谱分析已成为揭示细胞异质性和动态变化的重要工具。随着测序技术的迅速发展，科研学者能够更加精准地解析每个细胞的基因表达情况，并通过一系列分析方法揭示细胞分化、疾病进展等重要生物学过程。本文将深入介绍单细胞基因表达谱分析的核心技术，包括差异基因表达分析、伪时间分析与细胞轨迹推断，以期为科研人员提供实用的参考。

细胞聚类分析与类型识别：常用聚类算法与细胞群体注释方法

2024-11-12

本文详细介绍了单细胞RNA-seq分析中的细胞聚类分析与类型识别方法，涵盖了常用的聚类算法（如K-means、层次聚类、DBSCAN、SOM）以及细胞类型注释和细胞群体识别技术。细胞聚类分析，单细胞RNA-seq，K-means，层次聚类，DBSCAN，SOM，细胞类型注释，细胞群体识别，生物信息学，基因表达分析

单细胞数据的标准化与降维分析：全面解析PCA、t-SNE与UMAP技术

2024-11-11

本文深入探讨了单细胞数据标准化方法，包括TPM、RPKM、SCTransform等，并详细介绍了PCA、t-SNE、UMAP等降维技术的原理与应用，帮助研究人员选择最适合的分析方法。单细胞数据标准化，PCA，t-SNE，UMAP，降维分析，单细胞RNA-seq，SCTransform，生物信息学，数据处理，数据可视化

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